MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 chromosome

Total Repeats: 55366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007793	TAT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161673
2	NC_007793	CAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87161673
3	NC_007793	TGT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87161673
4	NC_007793	TAC	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161673
5	NC_007793	GAA	2	6	784	789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
6	NC_007793	TAA	2	6	804	809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161673
7	NC_007793	ACA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87161673
8	NC_007793	AAC	2	6	852	857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87161673
9	NC_007793	AG	3	6	880	885	50 %	0 %	50 %	0 %	87161673
10	NC_007793	ATT	2	6	996	1001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161673
11	NC_007793	ATGC	2	8	1039	1046	25 %	25 %	25 %	25 %	87161673
12	NC_007793	TCA	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161673
13	NC_007793	ATA	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161673
14	NC_007793	TTA	2	6	1124	1129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161673
15	NC_007793	TTA	2	6	1189	1194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161673
16	NC_007793	GAT	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161673
17	NC_007793	AAG	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
18	NC_007793	ACC	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	87161673
19	NC_007793	AGA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
20	NC_007793	TTG	2	6	1367	1372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87161673
21	NC_007793	CCA	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	87161673
22	NC_007793	AGA	2	6	1415	1420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
23	NC_007793	GAA	3	9	1426	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
24	NC_007793	CCA	2	6	1447	1452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	87161673
25	NC_007793	TA	3	6	1465	1470	50 %	50 %	0 %	0 %	87161673
26	NC_007793	CAAAT	2	10	1472	1481	60 %	20 %	0 %	20 %	87161673
27	NC_007793	ATT	2	6	1539	1544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161673
28	NC_007793	CTG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87161673
29	NC_007793	A	6	6	1637	1642	100 %	0 %	0 %	0 %	87161673
30	NC_007793	A	7	7	1686	1692	100 %	0 %	0 %	0 %	87161673
31	NC_007793	AG	3	6	1741	1746	50 %	0 %	50 %	0 %	87161673
32	NC_007793	GAA	2	6	1777	1782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
33	NC_007793	TGG	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87161673
34	NC_007793	TCAT	2	8	1808	1815	25 %	50 %	0 %	25 %	87161673
35	NC_007793	A	6	6	1823	1828	100 %	0 %	0 %	0 %	87161673
36	NC_007793	AGA	2	6	1845	1850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
37	NC_007793	AAG	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161673
38	NC_007793	TAAT	2	8	2177	2184	50 %	50 %	0 %	0 %	87160973
39	NC_007793	ATT	2	6	2208	2213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160973
40	NC_007793	TTA	2	6	2214	2219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160973
41	NC_007793	AAC	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87160973
42	NC_007793	AGT	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160973
43	NC_007793	TTG	2	6	2430	2435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87160973
44	NC_007793	A	7	7	2443	2449	100 %	0 %	0 %	0 %	87160973
45	NC_007793	ATTA	2	8	2497	2504	50 %	50 %	0 %	0 %	87160973
46	NC_007793	AATTT	2	10	2520	2529	40 %	60 %	0 %	0 %	87160973
47	NC_007793	TTA	2	6	2558	2563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160973
48	NC_007793	CAATT	2	10	2586	2595	40 %	40 %	0 %	20 %	87160973
49	NC_007793	CAAA	2	8	2627	2634	75 %	0 %	0 %	25 %	87160973
50	NC_007793	GACT	2	8	2719	2726	25 %	25 %	25 %	25 %	87160973
51	NC_007793	AGA	2	6	2758	2763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160973
52	NC_007793	TCA	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87160973
53	NC_007793	TAAA	2	8	2814	2821	75 %	25 %	0 %	0 %	87160973
54	NC_007793	GAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160973
55	NC_007793	TCT	2	6	2853	2858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87160973
56	NC_007793	TTTA	2	8	2875	2882	25 %	75 %	0 %	0 %	87160973
57	NC_007793	ATT	2	6	2911	2916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160973
58	NC_007793	ACA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87160973
59	NC_007793	AAATT	2	10	2964	2973	60 %	40 %	0 %	0 %	87160973
60	NC_007793	TTA	2	6	3020	3025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160973
61	NC_007793	GGT	2	6	3035	3040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87160973
62	NC_007793	TTA	2	6	3048	3053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160973
63	NC_007793	TGA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160973
64	NC_007793	GTT	2	6	3074	3079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87160973
65	NC_007793	TCT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87160973
66	NC_007793	AGA	2	6	3118	3123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160973
67	NC_007793	GGT	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87160973
68	NC_007793	TTCA	2	8	3163	3170	25 %	50 %	0 %	25 %	87160973
69	NC_007793	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	87160973
70	NC_007793	GATG	2	8	3184	3191	25 %	25 %	50 %	0 %	87160973
71	NC_007793	ATG	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160973
72	NC_007793	GTTGAA	2	12	3218	3229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160973
73	NC_007793	TTC	2	6	3230	3235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87160973
74	NC_007793	GAC	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87160973
75	NC_007793	AATT	2	8	3288	3295	50 %	50 %	0 %	0 %	87160973
76	NC_007793	ATT	2	6	3700	3705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160250
77	NC_007793	AAG	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160250
78	NC_007793	GTA	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160250
79	NC_007793	ATT	2	6	3769	3774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160250
80	NC_007793	TGG	2	6	3780	3785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87160250
81	NC_007793	ATTA	2	8	3819	3826	50 %	50 %	0 %	0 %	87160250
82	NC_007793	TTCT	2	8	3909	3916	0 %	75 %	0 %	25 %	87160250
83	NC_007793	TCAT	2	8	3920	3927	25 %	50 %	0 %	25 %	87160250
84	NC_007793	ATG	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161857
85	NC_007793	A	6	6	4203	4208	100 %	0 %	0 %	0 %	87161857
86	NC_007793	GTC	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87161857
87	NC_007793	AT	3	6	4256	4261	50 %	50 %	0 %	0 %	87161857
88	NC_007793	AGA	2	6	4292	4297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161857
89	NC_007793	CTC	2	6	4318	4323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	87161857
90	NC_007793	GAC	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87161857
91	NC_007793	CTG	2	6	4366	4371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87161857
92	NC_007793	AAT	2	6	4419	4424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161857
93	NC_007793	A	7	7	4450	4456	100 %	0 %	0 %	0 %	87161857
94	NC_007793	CAG	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87161857
95	NC_007793	AAG	2	6	4591	4596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161857
96	NC_007793	ATT	2	6	4609	4614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161857
97	NC_007793	GAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161857
98	NC_007793	ATA	2	6	4687	4692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161857
99	NC_007793	GAT	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161857
100	NC_007793	TTA	3	9	4875	4883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161857
101	NC_007793	GAT	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161857
102	NC_007793	TTA	2	6	4926	4931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161857
103	NC_007793	ACA	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87161454
104	NC_007793	GTAT	2	8	5158	5165	25 %	50 %	25 %	0 %	87161454
105	NC_007793	AG	4	8	5180	5187	50 %	0 %	50 %	0 %	87161454
106	NC_007793	ATA	2	6	5218	5223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161454
107	NC_007793	CAAAT	2	10	5251	5260	60 %	20 %	0 %	20 %	87161454
108	NC_007793	GTT	2	6	5265	5270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87161454
109	NC_007793	A	6	6	5335	5340	100 %	0 %	0 %	0 %	87161454
110	NC_007793	TGG	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87161454
111	NC_007793	TGGCGG	2	12	5396	5407	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	87161454
112	NC_007793	TGG	2	6	5420	5425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87161454
113	NC_007793	TCA	2	6	5442	5447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161454
114	NC_007793	TA	3	6	5501	5506	50 %	50 %	0 %	0 %	87161454
115	NC_007793	TCA	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161454
116	NC_007793	A	6	6	5520	5525	100 %	0 %	0 %	0 %	87161454
117	NC_007793	AAG	2	6	5548	5553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161454
118	NC_007793	CAG	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87161454
119	NC_007793	AG	3	6	5658	5663	50 %	0 %	50 %	0 %	87161454
120	NC_007793	TGA	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161454
121	NC_007793	AGA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161454
122	NC_007793	ATG	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161454
123	NC_007793	TCA	2	6	5822	5827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161454
124	NC_007793	GAT	2	6	5835	5840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161454
125	NC_007793	GGT	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87161454
126	NC_007793	AGA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161454
127	NC_007793	TATC	2	8	6061	6068	25 %	50 %	0 %	25 %	87161454
128	NC_007793	ATT	2	6	6146	6151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161454
129	NC_007793	TAT	2	6	6218	6223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161454
130	NC_007793	GGC	2	6	6224	6229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	87161454
131	NC_007793	TGC	2	6	6242	6247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87161454
132	NC_007793	A	6	6	6249	6254	100 %	0 %	0 %	0 %	87161454
133	NC_007793	CGT	2	6	6270	6275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	87161454
134	NC_007793	GAA	2	6	6339	6344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87161454
135	NC_007793	G	6	6	6378	6383	0 %	0 %	100 %	0 %	87161454
136	NC_007793	TAGA	2	8	6466	6473	50 %	25 %	25 %	0 %	87161454
137	NC_007793	TGGA	2	8	6592	6599	25 %	25 %	50 %	0 %	87161454
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259	NC_007793	AATG	2	8	11831	11838	50 %	25 %	25 %	0 %	87161623
260	NC_007793	GGT	2	6	11895	11900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87161623
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